最后，为了验证上述结论，分析了应用PD－1／PD－L1或CTLA－4治疗的患者的数据集，观察到高淋系和TIL评分与更好的无进展生存有关（图5A，B）。在另一个队列中也证实在转移性黑色素瘤的抗CTLA－4治疗中，高淋系和TIL评分与更好的无进展生存有关（图5C，D）。在另外两个应用PD－1／PD－L1疗法的队列中，高淋系评分也与更好的结果有关（图5E，F）。使用AUC作为评估标准，可发现基于淋系评分或TIL评分比经典signature（如EIG或免疫浸润）预测患者预后的性能更好（图5G－J）。接下来对两个队列中将TIL和淋巴评分与IMPRES、IPS和TIDE进行比较（图5G、H）。TIL评分在Dijon－Montreal队列中表现最好，但在Van Allen队列中表现最差，淋系评分表现则较为稳定。值得注意的是，在GSE数据中，因为相关基因表达数据缺失，TIL评分、IMPRES、IPS和TIDE无法被计算。
图5A－F．TIL和淋系评分高与低的患者无进展生存期的差异；图5G－J．基于TIL评分、淋系评分、CD3E、IPS、IMPRES以及TIDE在不同数据中对患者预后的预测性能
小结
在本篇学习笔记中提出了多种不同的可用于预测肿瘤预后的评分方法，通过泛癌分析，相关分析，LASSO模型等手段探究了这些评分之间的关联以及各自适用的范围，最终证明了基于40个基因的TIL评分以及其中包含的基于10个基因的淋系评分在肿瘤预后和免疫治疗疗效中的预测价值，而40或10个基因的模型相比于先前的模型体量也相对较小，更有临床应用的价值。
<上一页 3
