NEC发布基于AI的新型冠状病毒疫苗设计基因分析结果

NEC日前发布了采用AI预测技术的基因分析结果，用于设计可促进全球多数人群T细胞反应（注1）的SARS-CoV-2（新型冠状病毒）疫苗。本成果旨在帮助防止新型冠状病毒感染症“COVID-19”感染扩大，并支援全球疫苗开发，由NEC oncoImmunity AS（注2）与NEC欧洲研究所合作成立的研究团队所取得。本研究应用了NEC与NEC OncoImmunity在个体化癌症疫苗开发中使用的AI预测技术。

论文网站“bioRxiv”上发表的研究结果显示，分析数千种SARS－CoV－2的基因组序列，锁定了全球人群中最经常被找到的100个HLA等位基因（多种免疫型）的表位（可作为疫苗靶点）。

具体来说，不仅使用预测算法分析了作为冠状病毒名称起源的表面刺突蛋白，还分析了SARS-CoV-2的全部蛋白，根据所得数据，对多个HLA等位基因型锁定“热点（Hot Spot）”，该“热点”重复包含了SARS－CoV－2蛋白中的共通表位。另外，充分采用本算法，优先选定了全球人群覆盖最广、且病毒蛋白中变异较少、今后也很难发生变异的保存区域中获得的最佳热点组。并且，为确保安全性，除去了病毒表位中与人类蛋白相似度高、特别是在重要脏器中发现的热点。

本成果的分析结果展示了对世界多数人群安全有效、且亦能应对现在和将来的病毒多样性的疫苗设计，同时也体现了NEC集团AI预测技术的技术水平高度。

在公开本次研究成果、支援科学进步的同时，NEC将开启以加快疫苗开发为目的的合作活动。

NEC常务执行董事兼首席技术官西原基夫表示：“很高兴NEC的AI技术能够为当今世界面临的严重问题做出贡献。在世界各国都在为解决这一艰难课题而努力的情况下，NEC作为企业公民也有责任和义务参与到这一行动中。我们将以此次研究为开端，最大限度地活用AI技术这一NEC集团的优势，与各种各样的企业和机构合作，抑制新型冠状病毒感染症的扩大，为了让全球的人们能够尽早恢复日常生活而努力。”

NEC OncoImmunity的首席科学家Trevor Clancy博士表示：“敝公司首席执行官Richard Stratford博士和其团队以及NEC集团，对于我们针对个体化癌症免疫疗法的机器学习软件‘NEC Immune Profiler’从现在投入的癌症领域迅速适应感染症领域，并能够为新型冠状病毒感染症的应对提供支持，感到非常振奋。我们的AI和生物信息平台，不仅可以守护全球人类，而且对于现在和将来可能发生的新型冠状病毒的多种变异版本，还能够设计出可引发以长期记忆免疫反应等广泛免疫反应的疫苗，这是一种很大的鼓励。”

NEC欧州研究所数据科学与系统平台部门总经理Saverio Niccolini博士表示：“我们原本是为预测各个癌症患者的免疫反应而设计的算法，应用到了大规模的感染症群体。我们算法中的计算机验证（in silico验证）考虑到了人类在整个大陆的遗传背景。目前，全球正受到日益扩大的新型冠状病毒感染症的威胁，我们的成果显示了为阻止这一威胁的全球举措做出贡献的可能性，这是非常重要的。我们已开始与合作伙伴就wet-lab实验进行协商，正在为开发出对全球多数人群有效的疫苗而迈出重要的一步。”

论文信息

标题：

Artificial intelligence predicts the immunogenic landscape of SARS－CoV－2： toward universal blueprints for vaccine designs

作者：

Brandon Malone， Boris Simovski， Clément Moliné， Jun Cheng， Marius Gheorghe， Hugues Fontenelle， Ioannis Vardaxis， Simen Tenn?e， Jenny－Ann Malmberg， Richard Stratford， Trevor Clancy

（注1）T细胞反应：T细胞是白血球中的一种免疫细胞，激活T细胞的反应为T细胞反应。

（注2）总部：挪威奥斯陆、CEO：Richard Stratford。